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Au sein de l'UMR AMAP (Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations), vous concevez, développez et déployez des modèles d'Intelligence Artificielle de nouvelle génération pour l'observation à grande échelle de la biodiversité végétale et l'accompagnement de la transition agroécologique. Votre mission est de créer les premiers modèles de fondation souverains et de confiance dédiés au végétal, en vous appuyant sur la plateforme Pl@ntNet.

Vos principales activités à l'échelle du collectif AMAP :

⚬ Concevoir et entraîner «from scratch» de grands modèles de fondation par apprentissage auto-supervisé sur des corpus massifs de données végétales (dont plus d'un milliard d'images Pl@ntNet)

⚬ Développer des approches multimodales de données hétérogènes : images, textes, données tabulaires, séries temporelles ; gérer les données manquantes.

⚬ Concevoir des méthodes d'adaptation «cross-domain» pour transférer l'information entre vues de terrain, acquisitions par drones et spécimens numérisés d'herbiers, pour lever le verrou «few-shot learning» d'identification des espèces rares

⚬ Développer des approches hybrides (apprentissage profond et modèles mécanistes/écologiques d'Amap pour garantir l'interprétabilité écologique des prédictions et contribuer aux jumeaux numériques d'(agro)écosystèmes

⚬ Concevoir des protocoles d'évaluation rigoureux (incertitude, biais, reproductibilité)

⚬ Participer à l'industrialisation des modèles sur les infrastructures centralisées (Pl@ntNet) et concevoir, par « distillation », des modèles compacts, frugaux et embarquables (drones, smartphones) adaptés aux contraintes des partenaires du Sud.

Sur les 3 premières années, vos travaux s'inscrivent prioritairement dans le projet européen BEAGLE (Biodiversity Methods for Advanced Monitoring at Large Scales) pour :

⚬ Développer et opérationnaliser des chaînes de traitement à large échelles d'images issues de capteurs, réseaux citoyens, experts, généralisables et compatibles avec le standard Darwin Core et Humboldt Core.

⚬ Concevoir des modèles de fondation mono- et multimodaux combinant différents types de données (dont images, audio, ADN environnemental et métadonnées écologiques) pour la détection d'espèces rares ou sous-documentées et pour l'inférence écologique.

⚬ Contribuer à une infrastructure de référence et jeux de données de test pour évaluer en continu la fiabilité des modèles d'IA avec des experts.

⚬ Participer à l'intégration des flux de données d'observation participative vers les agrégateurs mondiaux (eg GBIF).

À moyen terme, vous participerez au montage de projets structurants pour le CIRAD et ses partenaires, à l'encadrement de (post-)doctorant.e.s, à la représentation de l'institut dans les réseaux nationaux et internationaux d'IA (LifeCLEF, TDWG, GBIF), à des formations académiques et la transmission des connaissances.

Vous êtes titulaire d'un doctorat (exigé) en informatique avec une spécialisation en intelligence artificielle, centrée plus spécifiquement sur l'apprentissage de représentations (apprentissage profond) et la vision par ordinateur. Vous justifiez d'une expérience post-doctorale ou équivalente démontrant votre capacité à concevoir et à entraîner des architectures neuronales à très grande échelle sur des données réelles complexes.

Compétences scientifiques et techniques (Savoir et Savoir-faire) :

⚬ Maîtrise approfondie de l'apprentissage profond (Deep Learning), de l'apprentissage auto-supervisé (Self-Supervised Learning) et des architectures modernes (Vision Transformers, modèles multimodaux, Foundation Models).

⚬ Solide expertise en méthodes d'adaptation de domaine (cross-domain), d'apprentissage à partir de peu d'exemples (few-shot learning), de fusion multimodale (gestion de données hétérogènes ou manquantes) et de distillation de modèles (IA frugale et embarquée).

⚬ Excellente maîtrise de l'écosystème PyTorch, du calcul à haute performance (infrastructures HPC / GPU) et des bonnes pratiques d'ingénierie et de déploiement de modèles (MLOps, reproductibilité, contrôle de version).

⚬ Capacité démontrée à valoriser vos recherches dans des conférences et revues internationales de premier plan en IA et/ou en informatique pour la biodiversité.

⚬ Maîtrise du français et de l'anglais (oral et écrit) indispensable pour l'animation de groupes de travail au sein de consortiums européens et internationaux.

Compétences comportementales (Savoir-être) :

⚬ Fort intérêt pour la recherche interdisciplinaire appliquée aux grands enjeux écologiques, agronomiques et de conservation de la biodiversité au Sud.

⚬ Aptitude au travail collaboratif avec des chercheur.se.s d'autres disciplines (écologues, botanistes, modélisateur.rice.s) et des ingénieur.e.s logiciels.

⚬ Capacité d'animation scientifique, d'encadrement et goût pour le partage ouvert des connaissances (Science Ouverte, principes FAIR) et le transfert technologique vers les partenaires des pays du Sud.

Merci de bien vouloir indiquer dans votre CV des références de responsables sur de précédentes fonctions que nous nous permettrons de contacter

Nos atouts ·

Pour les profils de cadres scientifiques :

Avantages sociaux : Vous bénéficiez d'un 13ème mois, plus, en mobilité géographique, d'indemnités spécifiques en fonction de la localisation et de la composition familiale. Vous bénéficiez également d'une assurance sociale complète quelle que soit la localisation.